1981年9月~1991年11月，冯飞在天津大学自动化系电力系统及其自动化专业学习，获工学学士、硕士、博士学位； 1991年11月~1993年9月，在清华大学电机工程系电工学科从事博士后研究； 1993年9月~1998年11月，在国务院发展研究中心技术经济研究部工作，历任助理研究员、副研究员、第二研究室副主任、第二研究室主任。 1998年11月~2014年1月，冯飞在国务院发展研究中心产业经济研究部工作，历任负责人(1999年9月评聘为研究员)、副部长、部长，兼任国家战略性新兴产业专家组副组长、国家863计划专家委员会专家； 2014年1月~2015年10月，任工业和信息化部产业政策司司长。 冯飞曾两次担任中央政治局集体学习的主讲人 据清华大学新闻网消息，2011年5月30日，十七届中共中央政治局就培育发展战略性新兴产业研究进行第二十九次集体学习。清华大学公共管理学院院长薛澜教授与国务院发展研究中心产业经济研究部部长冯飞就这个问题进行了讲解，并谈了他们的意见和建议。
另据新华网消息， 2006年12月25日，十六届中共中央政治局就我国建设资源节约型社会进行第三十七次集体学习。国务院发展研究中心产业经济研究部部长冯飞研究员、国家发展和改革委员会宏观经济研究院能源研究所所长韩文科研究员就这个问题进行讲解，并谈了他们对我国建设资源节约型社会的意见和建议。 由于工信部是一个技术性较强的单位，因此，工信部领导班子高学历是普遍现象，并且早前从事的领域大多与工信部有较大关联。比如陈肇雄是中国科学院计算所计算机应用专业博士，而且担任过中国电子信息产业集团总经理;怀进鹏为中国科学院院士、计算机软件专家;冯飞为自动化系电力系统及其自动化专业博士，此前在国务院发展研究中心产业经济研究部工作，兼任国家战略性新兴产业专家组副组长、国家863计划专家委员会专家。
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